O Programa de Pós-Graduação em Filosofia (PPGFIL) possui cursos de Mestrado e o Doutorado Acadêmicos em Filosofia da UFABC e tem como um de seus principais objetivos aliar essa formação interdisciplinar que é própria de nossa universidade com os elementos que são constitutivos da pesquisa em Filosofia, tendo em vista a tradição já estabelecida nessa área no Brasil. O Programa iniciou o curso de mestrado em 2015 e, cinco anos depois, em 2020, abriu sua primeira turma de Doutorado. 

O Mestrado Profissional em Filosofia (PROF-FILO) é um programa de pós-graduação destinado a ofertar curso de mestrado a professores de filosofia do ensino médio ou fundamental, na modalidade profissional, em rede e com abrangência nacional.